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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/12/2022 |
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Data da última atualização: |
23/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; MORAES, A. da C. L.; LARA, L. A. de C.; PIMENTA, R. J. G.; COSTA, E. A.; PINTO, L. R.; LANDELL, M. G. de A.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B.; CHIARI, L.; GARCIA, A. A. F.; KUROSHU, R. M.; LORENA, A. C.; GORJANC, G.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
ALEXANDRE HILD AONO, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS, UNIVERSITY OF EDINBURGH; REBECCA CAROLINE ULBRICHT FERREIRA, UNIVERSDIDADE DE CAMPINAS; ALINE DA COSTA LIMA MORAES, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; LETÍCIA APARECIDA DE CASTRO LARA, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA "LUIZ DE QUEIROZ"; RICARDO JOSÉ GONZAGA PIMENTA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ESTELAARAUJO COSTA, UNIVEDRSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO; LUCIANA ROSSINI PINTO, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; MARCOS GUIMARÃES DE ANDRADE LANDELL, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; MATEUS FIGUEIREDO SANTOS, CNPGC; LIANA JANK, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA "LUIZ DE QUEIROZ"; REGINALDO MASSANOBU KUROSHU, UNIVERSIDADE FERDERAL DE SÃO PAULO; ANA CAROLINA LORENA, INSTITUTO TECNOLÓGICO DE AERONÁUTICA; GREGOR GORJANC, UNIVERSITY OF EDINBURGH; ANETE PEREIRA DE SOUZA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS. |
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Título: |
A joint learning approach for genomic prediction in polyploid grasses. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, 12, article 12499, 2022. |
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Páginas: |
17 p. |
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ISSN: |
2045-2322 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-022-16417-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Poaceae, among the most abundant plant families, includes many economically important polyploid species, such as forage grasses and sugarcane (Saccharum spp.). These species have elevated genomic complexities and limited genetic resources, hindering the application of marker-assisted selection strategies. Currently, the most promising approach for increasing genetic gains in plant breeding is genomic selection. However, due to the polyploidy nature of these polyploid species, more accurate models for incorporating genomic selection into breeding schemes are needed. This study aims to develop a machine learning method by using a joint learning approach to predict complex traits from genotypic data. Biparental populations of sugarcane and two species of forage grasses (Urochloa decumbens, Megathyrsus maximus) were genotyped, and several quantitative traits were measured. High-quality markers were used to predict several traits in diferent cross-validation scenarios. By combining classifcation and regression strategies, we developed a predictive system with promising results. Compared with traditional genomic prediction methods, the proposed strategy achieved accuracy improvements exceeding 50%. Our results suggest that the developed methodology could be implemented in breeding programs, helping reduce breeding cycles and increase genetic gains. |
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Thesagro: |
Cana de Açúcar; Gramínea Forrageira; Recurso Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Forage grasses; Genetic resources; Plant breeding; Poaceae; Polyploidy; Saccharum; Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150365/1/Joint-learning-approach-genomic-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 9 | |
| 1. |  | CAMILO, B. G.; GUIEIRO, C. dos S. M.; SANTOS, K. K. B. dos S.; FREITAS, A. de; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; MARRIEL, I. E. Microbial activity in agricultural enriched with rocks, and bioinoculantes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 2. | | COTTA, S. P. M.; MARINS, M. S.; BATISTA, F. de C.; FREITAS, A. de; OLIVEIRA, M. C.; MARRIEL, I. E.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A. Isolamento e seleção de microrganismos termófilos potencialmente úteis para produção de enzimas hidrolíticas. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., 2016, Goiânia. Rumo aos novos desafios: [anais]. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2016. p. 1001. FertBio 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 3. | | FORNARE, A.; LORINI, I.; FREITAS, A. de M.; BUENO, A. L. R.; MOREIRA, D. da S.; LIMA, K. P. M.; NOGUEIRA, J. A. G. Tratamento preventivo dos grãos no controle de pragas do trigo armazenado. In: CONFERÊNCIA BRASILEIRA DE PÓS-COLHEITA, 7; SIMPÓSIO PARANAENSE DE PÓS-COLHEITA DE GRÃOS, 10, 2018, Londrina. Anais... Londrina: ABRAPOS, 2018. Trabalho 20. p. 267-271. Organizado por Irineu Lorini, Marcelo Alvares de Oliveira, Lêda Rita D'Antonino Faroni, Vildes Maria Scussel.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | LORINI, I.; FERRI, G. C.; FREITAS, A. de M.; ROSSATO, C. Desenvolvimento de Lasioderma serricorne (F.) (Coleoptera: Anobiidae) em grãos de soja armazenada. In: CONFERÊNCIA BRASILEIRA DE PÓS-COLHEITA, 5., 2010, Foz do Iguaçu. Anais ... Londrina: Abrapós, 2010. p. 363-366. il. Organizado por Irineu Lorini, Maria Cristina Zborowski de Paula, Adriano Divino Lima Afonso.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | MELO, I. G.; FREITAS, A. de; TEIXEIRA, F. V.; FERRAZ, L. de C. L.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; MARRIEL, I. E. Aumento de massa seca em plantas de milho adubadas com compostos orgânicos enriquecidos com rochas. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., 2016, Goiânia. Rumo aos novos desafios: [anais]. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2016. p. 1043. FertBio 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 7. | | SANTOS, K. K. B. dos; FREITAS, A. de; CAMILO, B. G.; OLIVEIRA, A. C. de; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; MARRIEL, I. E. Dinâmica da atividade da urease e arginase durante a compostagem de resíduos agrícolas enriquecidos com rochas potássicas e fosfáticas e bioinoculante. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 8. | | SOUZA, D. W. F. de; VARGAS, A. do N.; LORINI, I.; FREITAS, A. de M.; VAL, J. B. R. do. Efeito da temperatura no controle de Rhyzopertha dominica (F.) (Coleoptera, Bostrichidae) em grãos de trigo. In: CONFERÊNCIA BRASILEIRA DE PÓS-COLHEITA, 6., 2014, Maringá. Anais... Londrina: ABRAPOS, 2014. p. 170-176.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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